BstDNAPolymerase,LargeFragment(嗜熱脂肪芽孢桿菌DNA聚合酶大片段)是一種經(jīng)過(guò)改造的酶,它來(lái)源于嗜熱脂肪芽孢桿菌(Bacillusstearothermophilus)DNA聚合酶I,通過(guò)重組技術(shù)在大腸桿菌中表達(dá)并純化獲得。這種酶具有5'→3'的DNA聚合酶活性,但不具有5'→3'的核酸外切酶活性,因此它在等溫?cái)U(kuò)增反應(yīng)中非常有用,如環(huán)介導(dǎo)的等溫?cái)U(kuò)增(LAMP)和滾環(huán)擴(kuò)增(RCA)等。以下是BstDNAPolymerase,LargeFragment的一些關(guān)鍵特點(diǎn)和應(yīng)用:1.**等溫?cái)U(kuò)增**:BstDNAPolymerase,LargeFragment具有很強(qiáng)的鏈置換能力,適用于多種等溫?cái)U(kuò)增反應(yīng),這些反應(yīng)通常在50-68°C之間進(jìn)行,比較好反應(yīng)溫度為65°C。2.**快速測(cè)序**:由于其高聚合酶活性,BstDNAPolymerase,LargeFragment可以用于快速測(cè)序,特別是對(duì)于高GC含量的DNA模板或微量(納克量級(jí))DNA模板的測(cè)序。3.**全基因組擴(kuò)增**:BstDNAPolymerase,LargeFragment也可用于全基因組擴(kuò)增(WGA),這是一種在不需要熱循環(huán)儀的情況下擴(kuò)增整個(gè)基因組DNA的技術(shù)。4.**高dUTP耐受性**:與BstDNAPolymerase2.0相比,BstDNAPolymerase,LargeFragment在進(jìn)行等溫?cái)U(kuò)增時(shí)不具有將dUTP摻入合成的DNA鏈的能力,這使得它在某些應(yīng)用中更具優(yōu)勢(shì)。泛素從E1轉(zhuǎn)移到泛素結(jié)合酶E2的活性位點(diǎn)半胱氨酸殘基上,形成E2-泛素硫酯中間體。Recombinant Human CD69/CLEC2C Protein,His Tag
BstDNA聚合酶和TaqDNA聚合酶在分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)中都是常用的酶,但它們之間存在一些關(guān)鍵的不同點(diǎn):1.**來(lái)源和熱穩(wěn)定性**:-**TaqDNA聚合酶**來(lái)源于嗜熱菌Thermusaquaticus,具有很好的耐熱性,能夠承受PCR的熱變性步驟。-**BstDNA聚合酶**來(lái)源于嗜熱脂肪芽孢桿菌(Bacillusstearothermophilus),同樣具有較高的熱穩(wěn)定性,適用于等溫?cái)U(kuò)增,如LAMP技術(shù),無(wú)需PCR熱循環(huán)。2.**酶活性**:-**TaqDNA聚合酶**具有5'-3'聚合酶活性和5'-3'外切酶活性,但沒(méi)有3'-5'外切酶活性。這意味著它在DNA合成過(guò)程中可以校正一些錯(cuò)誤,但保真性相對(duì)較低。-**BstDNA聚合酶**具有5'-3'聚合酶活性和強(qiáng)鏈置換活性,但缺乏5'-3'外切酶活性。這使得它在等溫?cái)U(kuò)增中更為有效,尤其是在需要高保真度和快速擴(kuò)增的應(yīng)用中。3.**應(yīng)用領(lǐng)域**:-**TaqDNA聚合酶**主要用于PCR技術(shù),適用于各種DNA片段的擴(kuò)增,包括復(fù)雜模板和長(zhǎng)片段的擴(kuò)增。-**BstDNA聚合酶**特別適用于等溫?cái)U(kuò)增技術(shù),如LAMP,這些技術(shù)不需要溫度循環(huán),適用于快速、低成本的DNA擴(kuò)增。4.**擴(kuò)增速度和效率**:-**BstDNA聚合酶**在等溫?cái)U(kuò)增中顯示出比傳統(tǒng)TaqDNA聚合酶更快的擴(kuò)增速度和更高的產(chǎn)量,尤其是在優(yōu)化的LAMP反應(yīng)中。
T7EndonucleaseI(T7EI)是一種特殊的DNA內(nèi)切酶,具有以下特點(diǎn):1.**識(shí)別錯(cuò)配DNA**:T7EI能夠識(shí)別并切割不完全配對(duì)的DNA、十字型結(jié)構(gòu)DNA、Holliday結(jié)構(gòu)或交叉DNA以及異源雙鏈DNA。2.**切割位點(diǎn)**:T7EI切割錯(cuò)配位點(diǎn)5'端的、第二或第三個(gè)磷酸二酯鍵。3.**靈敏度**:T7EI對(duì)錯(cuò)配DNA的識(shí)別非常靈敏,能夠檢測(cè)并切割單堿基和多堿基的錯(cuò)配。4.**應(yīng)用**:T7EI常用于CRISPR/Cas9等基因編輯技術(shù)導(dǎo)致的基因突變的鑒定。它通過(guò)識(shí)別錯(cuò)配DNA來(lái)幫助鑒定基因編輯是否成功以及是否有非目標(biāo)效應(yīng)。5.**直接電泳檢測(cè)**:T7EI的產(chǎn)物可以直接通過(guò)電泳進(jìn)行檢測(cè),這使得它在實(shí)驗(yàn)操作中更為方便。6.**來(lái)源**:T7EI來(lái)源于大腸桿菌菌株,是一種麥芽糖結(jié)合蛋白(MBP)和T7核酸內(nèi)切酶I(T7EI)的融合蛋白。7.**成本效益**:盡管T7EI在商業(yè)上使用時(shí)成本較高,但它在大規(guī)模樣本測(cè)試中,尤其是在基因突變鑒定方面,提供了一種有效的篩選方法。8.**特殊注意事項(xiàng)**:T7EI能夠識(shí)別長(zhǎng)度大于或等于2bp的插入、缺失或突變導(dǎo)致的錯(cuò)配DNA,但不能識(shí)別1bp的插入、缺失或突變。這些特點(diǎn)使得T7EndonucleaseI成為基因突變鑒定中一個(gè)非常有用的工具,尤其是在CRISPR/Cas9等基因編輯技術(shù)的應(yīng)用中。
DNA片段大小對(duì)磁珠法DNA凝膠回收試劑盒的回收率有影響。根據(jù)搜索結(jié)果,我們可以得出以下結(jié)論:1.**小片段DNA(小于200bp)**:對(duì)于小于200bp的DNA片段,回收率會(huì)下降。這是因?yàn)樾∑蔚腄NA與固相基質(zhì)的結(jié)合力相對(duì)較弱,因此相對(duì)損失較大,導(dǎo)致回收率降低。在某些情況下,小于100bp的DNA片段的回收率可能只有30-60%。2.**中等大小片段DNA(200bp-4kb)**:在這個(gè)范圍內(nèi)的DNA片段,通?;厥章瘦^高,可以達(dá)到80-95%。這是因?yàn)檫@些片段大小適中,既不會(huì)因太小而損失,也不會(huì)因太大而難以洗脫。3.**大片段DNA(大于4kb)**:對(duì)于大于4kb的DNA片段,回收率也會(huì)下降,通常在30-50%之間。這是因?yàn)榇笃蔚腄NA與固相基質(zhì)的結(jié)合力更強(qiáng),因此更難洗脫。4.**片段大小與回收率的關(guān)系**:DNA片段越大,和固相基質(zhì)的結(jié)合力越強(qiáng),就越難洗脫,回收率就越低。相反,DNA的量越少,相對(duì)損失越大,回收率也越低。5.**操作技巧**:為了提高回收率,可以采取一些操作技巧,比如減少切膠體積、確保溶膠徹底、使用合適的洗脫液體積和pH值等。
質(zhì)粒DNA提取后的儲(chǔ)存條件對(duì)于保持其活性至關(guān)重要。以下是一些推薦的儲(chǔ)存方法:1.**干燥保存**:質(zhì)粒DNA以干粉狀態(tài)保存是比較好的方法。如果總DNA以溶液形式保存,可以使用1×TE緩沖液稀釋,且TE緩沖液的pH值應(yīng)為8.0-8.5之間。2.**低溫保存**:植物總DNA低溫保存比較好在-80℃以下或液氮保存。如果沒(méi)有條件,也可以在-20℃保存。總DNA應(yīng)避免經(jīng)常凍融,同時(shí)建議每份樣品保存3-5個(gè)樣本??侱NA提取后保存的時(shí)限通常較組織要長(zhǎng)(>兩年),但若長(zhǎng)期保存,每隔兩年應(yīng)抽測(cè),對(duì)不符合使用要求的DNA進(jìn)行更新。3.**避免反復(fù)凍融**:反復(fù)凍融會(huì)破壞DNA的完整性和活性,因此應(yīng)盡量避免。4.**使用保護(hù)劑**:化學(xué)添加劑如二甲基亞砜(DMSO)可以防止DNA單鏈斷裂,但因其毒性和使用量的問(wèn)題,并不是理想的保護(hù)劑。5.**封裝技術(shù)**:通過(guò)封裝技術(shù)保存DNA,可以隔絕外界水、氧氣和光等可能影響DNA穩(wěn)定的因素。例如,DNAshell®技術(shù)基于密封的不銹鋼微型膠囊,在惰性氣氛下,給予DNA干粉保護(hù)。6.**使用穩(wěn)定劑**:一些天然的雙糖,如海藻糖,被認(rèn)為是一種多功能的保護(hù)劑,可以保護(hù)生物體免受冷凍、加熱等不利條件的影響。FnCas12a在切割DNA時(shí)產(chǎn)生黏性末端,有助于提高同源定向修復(fù)(HDR)的效率。Recombinant Human SPARC(BM-40)
FnCas12a可以識(shí)別不同的PAM序列,例如5'-TTN-3',這增加了它可以靶向的基因組區(qū)域 。Recombinant Human CD69/CLEC2C Protein,His Tag
磁珠法提取的DNA通常指的是通過(guò)磁珠吸附技術(shù)從樣本中純化得到的核酸,而基因組DNA(gDNA)是指一個(gè)生物體細(xì)胞核中包含的全套遺傳信息的DNA。兩者的主要區(qū)別在于:1.**來(lái)源和組成**:-磁珠法提取的DNA可以是基因組DNA,也可以是質(zhì)粒DNA、線粒體DNA等其他類型的DNA。它是一個(gè)廣的概念,指的是通過(guò)磁珠法技術(shù)提取的任何類型的DNA。-基因組DNA特指一個(gè)生物體細(xì)胞核中的DNA,包含了所有的基因信息,以及可能的非編碼區(qū)域。它通常包含了大量的堿基對(duì),如人類基因組由大約30億個(gè)堿基對(duì)組成。2.**純度和應(yīng)用**:-磁珠法提取的DNA的純度和質(zhì)量取決于提取過(guò)程中的裂解、吸附、洗滌和洗脫步驟,以及磁珠的質(zhì)量和操作條件。高質(zhì)量的磁珠法提取的DNA可以用于多種分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn),如PCR、克隆、測(cè)序等。-基因組DNA的提取通常需要考慮其完整性和純度,以確保后續(xù)實(shí)驗(yàn)的準(zhǔn)確性?;蚪MDNA提取的難點(diǎn)在于血液樣本成分復(fù)雜,且白細(xì)胞體積占比低,因此提取純化難度較高。3.**提取方法**:-磁珠法提取DNA是一種高效、快速的核酸提取技術(shù),它利用磁珠表面修飾的特定官能團(tuán)與核酸的特異性結(jié)合,通過(guò)外加磁場(chǎng)實(shí)現(xiàn)核酸與雜質(zhì)的快速分離。Recombinant Human CD69/CLEC2C Protein,His Tag